杉並さんの告白イベントｷﾀｰ！
人生で初めて告白されてウヘウヘしてた理樹ですが、しかし頭の中にあったのは鈴のことばかりで、杉並さんの気持ちに応えるかどうかなんてさらさら考えちゃいなかったのでした。
うーんこのぐう畜主人公。杉並さん可愛いけど、出会うのが遅すぎたか…。

さて、ギャルゲらしからぬロマンチックさの皆無な告白イベントを経て、なんとなく恋人同士になった理樹と鈴。
祝福する恭介たちだけど、しかし、そんな二人の幸せな姿を見届けて、サブヒロイン３人が光の中に消えていく…？
そして、そうなることを知っていたかのような恭介、真人、謙吾。『世界の秘密』を知らないのは理樹と鈴だけだったのか…。
『世界の秘密』を知るための最後の指令の内容は、ホームルームで何かに立候補すること。人見知りな鈴には難易度が高そうですが、サブヒロインの中で小毬だけがまだ消えずにいるのは、友人として、鈴が最後の指令をやり遂げられるよう背中を押す役目が残っているからなのかな。
小毬が役目を終えて消え、リトルバスターズのオリジナルメンバーだけが残った時、この世界に一体何が起きるのか…？